Forskarskolans verksamhet är ytterst reglerad av högskoleförordningens regler och krav för doktorsexamen. Huvudavtalet (MIUN 2013/1349) mellan de olika lärosätena bestämmer forskarskolans innehåll, inriktning och styrning. Andra avtal reglerar externt finansierade licentianders/doktoranders, Mittuniversitetets och tredje parts ansvar och skyldigheter.